La gare d'Issé est inaugurée le 17 décembre 1877 lors de la mise en exploitation de la ligne Nantes - Châteaubriant. Elle dessert les populations d'Issé, Saint-Vincent des Landes, Louisfert et Moisdon-la-Rivière soit un bassin de 7 169 habitants en 1874. Les activités de la gare d'Issé sont essentiellement centrées autour du transport de minerai. De nombreux aménagements sont réalisés pour faciliter l'expédition de ces matières premières : (aménagement d'une seconde entrée dans la cour des marchandises (1889), agrandissement de la halle aux marchandises (1890), établissement d'un quai à minerai et d'une voie à débord (1890), établissement d'une voie Decauville pour la Société des mines de fer de Segré pour relier la minière du Houx à la gare de marchandises (1913), construction d'un hangar par la Société des usines métallurgiques de la Basse-Loire (nouveau nom de la société des mines de fer de Segré) pour y remiser la locomotive en service sur la voie Decauville (1914). En 1906, le conseil municipal demande à retarder le train du soir n° 1416 d'un quart d'heure afin de disposer de plus de temps pour l'envoi des beurres fabriqués par la laiterie Jouzel. Cette demande est refusée, car ce retard entrainait un problème des correspondances pour les voyageurs en direction de Savenay et Lorient. En 1916, M. Devain négociant en écorces pour sa tannerie obtient la construction d'un hangar entre les voies 7 et 9 (64 m de long sur 15 m de large). (NB : M. Devain investit en 1914 les locaux de l'ancienne laiterie-beurrerie Jouzel pour installer une tannerie sur les bords du Don). Le cheminement des marchandises se fait à travers la ville d'Issé jusqu'à l'usine via une voie type Decauville avec des wagonnets. Les 26 juin 1944, un train allemand de 42 wagons de munitions se dirigeant vers le front normand stationne en gare d'Issé. Le 27 juin 1944, les avions anglais le bombardent. D'après les témoins, les explosions se succèdent tout au long de l'après-midi et la nuit : la halle aux marchandises et le café de la gare sont en partis détruits. Dans les années 1960, les deux principaux utilisateurs de la gare sont l'usine d'engrais Phosphoguano et l'usine Atlas qui expédie des matières plastiques. La voie Decauville est abandonnée au profit de remorque porte-wagons. En 1976, la sécheresse influe sur l'activité de la gare, car un grand convoi de paille est acheminé par le comité sécheresse d'Issoudun. La gare a cessé son activité en 1980 lors de la fermeture de la ligne ferroviaire Nantes-Châteaubriant. Dans le cadre de la réouverture de la ligne Nantes-Châteaubriant, le bâtiment des voyageurs et la halle aux marchandises ont été détruits pour être remplacés par un parking et du mobilier urbain.