L'important rehaussement apporté à ce moulin, comme à quelques autres tels ceux de Careil à Guérande, ou de la Paquelais à Savenay, a conduit à les surnommer moulin grosse-tête, eu égard à leur silhouette caractérisée par la disproportion de leur partie supérieure. Ce rehaussement était possible grâce à l'adoption de la voilure en planches du type Berton, qui pouvait être positionnée loin du sol puisqu'il n'y avait plus besoin de grimper sur les ailes pour en régler l'ouverture. Par ailleurs, cette modification permettait d'augmenter la surface de travail et de stockage dans le moulin. Un autre perfectionnement technique était en usage au Moulin de la Mothe de Clis, au début du XXe siècle, comme on le voit sur la photographie déjà mentionnée : le gouvernail automatique, ou papillon d'orientation. Sur le toit, à l'opposé des ailes, un moulinet vertical était installé dans un bâti, qui étant actionné par le vent latéral, entraînait une transmission à crémaillère qui faisait virer la coiffe et remettait automatiquement les ailes au vent.