Le presbytère apparaît sur le plan cadastral de 1835, dans la partie orientale de l'espace presque triangulaire délimité par la rue de la Cure et la rue de Mervent. Le jardin du presbytère en occupe la partie occidentale.

Abritant déjà le curé avant la Révolution, le lieu est saisi comme bien national et semble réservé, en 1795, pour loger l'institutrice et aussi une chambre commune pour tenir les séances de la municipalité. L'ancien presbytère est finalement vendu aux enchères le 17 juin 1796 (29 Prairial an IV) et acquis par Philippe Brivin, chirurgien à Benet (avec MM. Bergeron et Tristant à qui il rachète leurs parts). Il le revend le 17 janvier 1807 (acte devant Me Tristant, notaire à Benet) à Jean Guitton, demeurant à la Chaignée, commune de Coulon. Le 31 août 1813, les communes de Benet et de Lesson, désireuse de retrouver un logement convenable pour le curé, rachètent l'ancien presbytère à Guitton. Le lieu comprend une maison avec chambres basses et hautes, des greniers par-dessus, une écurie, une grange, une cave, une cour et un jardin. Différents travaux sont menés au presbytère en 1846 et 1858. A cette époque, le bâtiment comprend un salon de compagnie, une salle à manger, une chambre à l'étage, etc.

Les 14 mai et 4 novembre 1866, le conseil municipal constate l'état de délabrement du presbytère et en confie la reconstruction à l'architecte départemental Victor Clair. Le nouveau bâtiment devra être suffisant pour loger le curé et son vicaire. Comme pour l'église à la même époque, la contribution financière de la commune de Lesson est sollicitée, la paroisse de Benet englobant Lesson. Les travaux ont lieu en 1869, adjugés à l'entrepreneur Soulisse.

En 1910, la commune réinvestit les lieux pour y installer l'école primaire communale de filles, qui quitte ainsi ses locaux de la place de la Résistance. Le projet d'aménagement est conçu par l'agent voyer cantonal Jeanneau (ou Jeanot) et approuvé en conseil municipal le 19 décembre 1909. Les travaux sont adjugés le 30 janvier 1910.

Cette opération engendre toutefois un contentieux entre les communes de Benet et de Lesson : à l'occasion de la désaffectation du presbytère, la commune de Lesson revendique un septième de la valeur du bâtiment qui, au lieu d'être réaffectée à l'école communale de filles de Benet et ainsi ne profiter qu'à cette commune, pourrait être vendu. Un procès s'engage devant le tribunal civil de Fontenay-le-Comte qui dépêche l'architecte Abel Filuzeau pour expertiser le bâtiment. Le 18 novembre 1911, cette expertise décrit ainsi l'ancien presbytère, avant transformation en école : une vaste maison d'habitation entre cour et jardin, comprenant au rez-de-chaussée un vestibule avec escalier, une cuisine, une salle à manger, un salon, ainsi que quatre chambres et trois cabinets de toilette à l'étage, sous un grenier comprenant deux chambres mansardées ; un bâtiment de servitudes (écurie, remise, buanderie et grenier) au bord du chemin est ; enfin, un hangar le long du chemin nord et reliant les deux précédents. Le contentieux entre les deux communes n'est réglé qu'en 1916 : la commune de Benet, qui conserve le bâtiment affecté à l'école, verse une indemnité de 2100 francs à celle de Lesson.