Le très important réseau de galeries souterraines de Pontencheri apparaît déjà sur le cadastre de 1834 ; les aménagements sont alors pour la plupart qualifiés de "caves". La forme des galeries suggère que celles-ci ont été creusées pour en extraire des pierres de taille calcaires. La carrière n'est cependant pas mentionnée sur la carte dressée en 1929 par les services des Ponts et chaussées du département de la Sarthe, ce qui indique qu'elle n'est plus en activité à cette période.

Les bâtiments présents aux entrées des galeries datent pour la plupart de la deuxième moitié du XIXe siècle (parfois avec quelques éléments plus anciens). Une reprise notable est réalisée dans le deuxième quart du XXe siècle sur l'un des bâtiments de l'entrée sud (décor de ciment rustiqué), probablement dans le contexte de la conversion de la carrière en champignonnière à partir des années 1930 ; cette dernière cesse d'être exploitée en 1992.