Un "seigneur de la Guilbardière" est cité dans les comptes de la châtellenie de Lassay en 1492-1492, sans que son nom ne soit spécifié. Il dépendait directement de la baronnie du Horps. Au vu de l'architecture, il n'y a pas de doute sur le fait que le manoir se trouvait dans la maison orientée est-ouest, dite maison 2. L'époque exacte du déclassement de ce site n'est pas connue, mais il est probable qu'elle se situe entre le milieu du XVIe siècle et le milieu du suivant.

La partie centrale est la plus ancienne et constituait sans doute le manoir originel : les murs des pièces accolées de part et d'autre ont en effet été construits postérieurement. Sa maçonnerie de moellons épais grossièrement assisés et équarris, ses portes jumelées à arc surbaissé, sa porte en plein cintre sur l'ancien mur-pignon orientale, aujourd'hui obstruée, son étroite demi-croisée dotée d'une grille et d'un coussiège et le chanfrein ornant toutes ces ouvertures permettent d'envisager une datation du XVe siècle.

Le rez-de-chaussée du manoir était divisé en deux pièces : une pièce froide à l'ouest et une salle chauffée par une imposante cheminée à l'est, occupant les deux tiers de la superficie globale. Cette salle basse était accessible par la porte à arc surbaissé du mur gouttereau sud et par celle en plein cintre du mur-pignon oriental. L'étage était habitable, doté d'une cheminée ornée de colonnettes et partageant le conduit de celle de la salle basse. Il est possible que cet étage n'ait été composé que d'une seule grande pièce occupant la superficie globale du manoir et que la cloison ait été ajoutée a posteriori. La charpente originelle ayant disparu, il est impossible de savoir si cette pièce montait sous comble L'emplacement et la forme de l'organe de distribution de l'étage est également inconnu.

Le manoir originel a été agrandi vers l'ouest au XVIe siècle. Bien que cet ajout présente également des caractéristiques élitaires (baie à croisée, surmontée de deux accolades et dotée d'un coussiège, demi-croisée obstruée sur le mur nord, également dotée d'un coussiège, étage habitable), les deux ensembles ne communiquaient pas. Peut-être cette seconde construction a-t-elle remplacé l'édifice primitif dans ses fonctions. La distribution originelle de l'étage est inconnue, mais un renflement arrondi dans la maçonnerie de l'ancien mur gouttereau nord suggère la présence d'un escalier à vis. La charpente ne semble pas être d'origine ; la pente du toit coupe la demi-croisée du mur gouttereau sud, qui est peut-être une ancienne lucarne passante. Ce second ensemble a été agrandi, probablement au XVIIIe siècle, d'une pièce quadrangulaire au nord, dotée d'une pierre d'évier et d'une cheminée.

En 1619, une maison est accolée à l'est du manoir primitif. Cette date est portée sur le linteau de bois intérieur de la porte ; à la fin du XVIIIe siècle, une écurie est construite dans le prolongement de cette dernière. C'est également au cours de ce siècle que le manoir primitif a été divisé en plusieurs ensembles autonomes : une cheminée a été construite au niveau inférieur de son ancienne pièce froide et une fenêtre percée à l'étage.