L'école des garçons de Niort-la-Fontaine est rebâtie en 1858, sur un plan dressé par l'architecte François Godin, à l'emplacement de l'ancienne maison d'école, entièrement détruite. Cette dernière nous est connue par une brève description dressée par l'instituteur dans la monographie communale : il s'agissait d'une petite maison basse, composée de deux pièces.

Les matériaux de la première maison d'école sont réemployés, ce qui explique la présence d'un linteau portant la date de 1828 au-dessus de la fenêtre du premier étage de la travée centrale de la façade arrière. Le devis estimatif des matériaux provenant de la démolition de l'ancienne école, effectué en 1858, explicite le remploi de trois croisées sur la façade arrière. De même, le bois de charpente, les portes, les ardoises ainsi que des pierres retaillées pour l'occasion sont réutilisés. Le procès-verbal de réception des travaux de la nouvelle école est dressé en 1862.

En 1905, un nouveau bâtiment est édifié le long de la route du Housseau pour accueillir la classe des petits, auparavant située dans l'annexe située à l'est de la classe principale, et à l'étage le logement de l'adjoint. La mairie est alors installée dans l'annexe orientale. L'architecte Jules Tessier de Mayenne dirige ces travaux.