Implantée au nord-est de la station balnéaire, la gare de La Bernerie-en-Retz présente un plan et une élévation similaires aux autres gares de cette ligne, elle se distingue cependant par la présence d'un étage suplémentaire. Le soubassement de l'édifice est en moellons de schiste régulièrement taillés, les chaînages et les ouvertures sont encadrés de brique. Un hangar à bagage présentant des pignons à ferme débordante reposant sur des poteaux de bois prolonge le bâtiment principal.